Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Otud4B2RRE7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Otud4B2RRE7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms