Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CadB2RQC6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CadB2RQC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CadB2RQC6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms