Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930402K13RikB1AW18 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930402K13RikB1AW18 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms