Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grik3B1AS29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik3B1AS29 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms