Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox1B1APN4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox1B1APN4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox1B1APN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms