Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Herc3A6H6S0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Herc3A6H6S0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Herc3A6H6S0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms