Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pramef17A2ASJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pramef17A2ASJ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pramef17A2ASJ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms