Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Patl2A2ARM1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Patl2A2ARM1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Patl2A2ARM1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms