Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rtf1A2AQ19 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtf1A2AQ19 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtf1A2AQ19 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms