Protein–RNA interactions for Protein: A2APA5

Fam209, 1700029J11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam209A2APA5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam209A2APA5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam209A2APA5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Fam209A2APA5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam209A2APA5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam209A2APA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms