Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ambra1A2AH22 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ambra1A2AH22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ambra1A2AH22 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms