Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2dnl2A2AFH2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2dnl2A2AFH2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms