Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itgb4A2A863 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itgb4A2A863 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Itgb4A2A863 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms