Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc173A0JLY1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc173A0JLY1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc173A0JLY1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms