Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv13-2A0A140T8N6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms