Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Igkv1-132A0A0B4J1H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms