Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trbv5A0A0B4J1G9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trbv5A0A0B4J1G9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv5A0A0B4J1G9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv5A0A0B4J1G9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv5A0A0B4J1G9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trbv5A0A0B4J1G9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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