Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm28510A0A087WP28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Gm28510A0A087WP28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm28510A0A087WP28 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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Gm28510A0A087WP28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Gm28510A0A087WP28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28510A0A087WP28 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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