Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B654

Trav3-4, T cell receptor alpha variable 3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-4A0A075B654 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trav3-4A0A075B654 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav3-4A0A075B654 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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