Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W3

Ighv1-53, Immunoglobulin heavy variable 1-53 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ighv1-53A0A075B5W3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ighv1-53A0A075B5W3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms