Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ighv5-6A0A075B5Q0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms