Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac6Q9Z2V5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac6Q9Z2V5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac6Q9Z2V5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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