Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tsc22d3Q9Z2S7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tsc22d3Q9Z2S7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms