Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt16Q9Z2K1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt16Q9Z2K1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms