Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Letm1Q9Z2I0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Letm1Q9Z2I0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Letm1Q9Z2I0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms