Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mbd4Q9Z2D7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mbd4Q9Z2D7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms