Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdc45Q9Z1X9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc45Q9Z1X9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms