Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ilf3Q9Z1X4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ilf3Q9Z1X4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms