Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lgr5Q9Z1P4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgr5Q9Z1P4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms