Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phf1Q9Z1B8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf1Q9Z1B8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf1Q9Z1B8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms