Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sumo3Q9Z172 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sumo3Q9Z172 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms