Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Creb3l1Q9Z125 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Creb3l1Q9Z125 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l1Q9Z125 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Creb3l1Q9Z125 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms