Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbp2Q9Z0E6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp2Q9Z0E6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp2Q9Z0E6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms