Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stxbp4Q9WV89 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stxbp4Q9WV89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp4Q9WV89 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp4Q9WV89 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp4Q9WV89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp4Q9WV89 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stxbp4Q9WV89 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms