Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VapaQ9WV55 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VapaQ9WV55 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms