Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bgrQ9WUZ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sh3bgrQ9WUZ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms