Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip1Q9WUU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip1Q9WUU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms