Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Opn3Q9WUK7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Opn3Q9WUK7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms