Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CcsQ9WU84 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CcsQ9WU84 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcsQ9WU84 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CcsQ9WU84 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms