Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pus1Q9WU56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pus1Q9WU56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms