Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lemd3Q9WU40 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Lemd3Q9WU40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Lemd3Q9WU40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms