Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn5Q9WU28 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn5Q9WU28 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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