Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrf1Q9WU00 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nrf1Q9WU00 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nrf1Q9WU00 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 204.4 ms