Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp18Q9WTV6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
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Usp18Q9WTV6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Usp18Q9WTV6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp18Q9WTV6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms