Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema6cQ9WTM3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema6cQ9WTM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms