Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc6Q9R1S7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Abcc6Q9R1S7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc6Q9R1S7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms