Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb3Q9R1P1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Psmb3Q9R1P1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms