Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trex2Q9R1A9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trex2Q9R1A9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms