Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SrpxQ9R0M3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrpxQ9R0M3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms