Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zeb2Q9R0G7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zeb2Q9R0G7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zeb2Q9R0G7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms